该科设立床位30张；另拥有先进的层流净化病房，床位数3张。该科在小儿血液病的临床研究和诊治方面有较高的水平，对白血病、特发性血小板减少性紫癜、血友病、地中海贫血、再生障碍性贫血、缺铁性贫血等疾病的诊治具有十分丰富的临床经验，治疗手段先进。此外还收治各种原因引起的贫血，肝脾淋巴结肿大、血三系减少及长期发热病人。一些疑难罕见病例（如尼曼匹克病、组织细胞增多症、嗜血细胞增多综合症）及重症传单、再障、严重溶血亦能得到及时确诊及治疗。该科在化疗方面取得的疗效显著，对于儿童常见的血液系统恶性肿瘤—急性淋巴细胞白血病的缓解率可达90%以上。在干细胞移植方面，于1997已将自体干细胞移植术用于治疗儿童恶性淋巴瘤并获得成功，早年治疗的病例术后良好，目前更向脐带血移植方向迈进。