深圳市第二人民医院运动医学科就是为了适应社会和医学发展需求，在卫生局、医院领导的高度重视下，集合医院原有的骨关节创伤专业骨干和技术精英，于2006年11月成立，是当时华南地区唯一的运动医学专科。
运动医学科的成立，为广大急慢性运动损伤患者，特别是广大体育爱好者提供了一个专业的辅助平台与保障平台，填补了该市在运动医学专科领域没有专业队伍的空白。自该院运动医学科成立以来短短近五年时间以来，所施行的关节镜手术量是该院建院以来过去25年总和的20倍，该科发展的特点是：
　　1．高起点：北医三院专家定期来院讲学、示教，该院每年派人赴三院进修；还定期选派骨干赴华山医院、港大威尔士亲王医院进修，赴美国匹兹堡大学、德国海德堡运动医学中心等地进修，并保持了与上述各机构的长期合作关系。不断拓展国内国际视野，每年均参加各种国际知名的运动医学大会，主办与承办多次国内运动医学研讨会，使他们的运动医学理念得以发扬，国外的运动医学新理念得以及时应用。
　　2．快发展：随着业务快速发展，目前该科已连续3年稳座华南地区关节镜手术量第一，全国前五。2007年该科被评为卫生部关节镜培训基地。3年来该科获得国家及省市课题立项20余项，基金总额超过250万元；3年来发表SCI论文10篇，其他国家级论文45篇。该科目前是众多国际、国内权威学术机构的委员单位。该科在国内首先提出的“前交叉韧带个体化解剖重建”、“肩袖损伤无锚钉修复技术”等理论，获得国内外同行的一致认同，该科目前在运动医学与关节镜领域，已经处于全国先进、全省领先地位。
目前，该院运动医学科经过近五年的建设，已成为华南地区最大的运动医学临床研究机构。科室所在的骨科2011年被评为全国重点骨科,享受卫生部500元人民币的资助。科室医护人员共有32名，其中正高级职称4名，副高3名，具有博士学位有5人，硕士学位6人。共开设病床32张，具有计算机辅助导航手术系统、GCP细胞实验室、高清关节镜手术系统等先进设备。开展业务有全身各大关节镜手术、计算机导航辅助前后交叉韧带重建、1、2、3代关节大面积软骨缺损的自体软骨细胞移植修复手术、全关节镜下巨大肩袖损伤修复手术、全关节镜下髋臼盂唇修复手术。
　　运动创伤和关节镜技术得到快速提高和发展，医疗质量高，社会影响大，病人来自广东各市县、广西、贵州、湖南、江西、湖北、福建、加拿大、荷兰、俄罗斯、澳门、香港等地。会诊范围达广东省各市县、广西、贵州、云南、湖北、江西、湖南等地。在院领导和科室领导带领下，学科已成功开展膝、肩、踝、肘、髋、腕等六大关节40余种关节镜手术，2015年门诊量达1.2万人次，年住院病人达1500人次。