2003年12月中国人民解放军总后勤部卫生部正式批准由第二军医大学第二附属医院(上海长征医院)器官移植中心组建中国人民解放军器官移植研究所。作为目前器官移植专业全军最高级别的医教研集合体，研究所于2004年5月16日正式挂牌成立。 长征医院全军器官移植研究所目前共有肾移植、肝移植两个病区，共有医师20名，护士31名。师中教授、博士生导师3人，副教授、硕士生导师3人，主治医师11人，住院医师3人。研究所下设6个实验室，包括：移植免疫实验室、移植病理实验室、器官保存实验室、药物浓度监测室、组织配型室以及动物实验室。

学科带头人朱有华，男，52岁，主任医师，教授，博士生导师。兼任中华医学会器官移植学会常委;《中华器官移植杂志》副主编;《中国外科年鉴》编委;中国透析移植研究会常委;全军泌尿外科专业委员会委员;国际泌尿外科学会会员。副所长傅志仁教授，博士生导师，是全军肝胆外科学术委员会常委;上海市肝病研究中心委员;上海市健康教育协会委员;上海市药品不良反应监测中心委员。副所长王立明副教授是中华器官移植学会上海分会青年委员。

全军器官移植研究所自1978开始开展肾移植工作，迄今已完成2800余例次;1996年开始开展肝移植，迄今完成近300例次;肝肾联合移植3例，胰肾联合移植2例，心脏移植1例。移植总例次及成功率均居全国前茅。多年来获国家科技进步二等奖1项，军队医疗成果一等奖1项，军队科技进步及军队医疗成果二、三等奖多项。

研究所在器官移植的临床研究和基础科研方面都有着很强的基础和实力。目前在研的国家、省部级及医院基金6项，基金总额约350万元。近五年来撰写移植医学专著8部。 研究所目前主要的基础科研方向是：1、新型多器官保存液的研究;2、新型免疫抑制剂的作用机制研究;3、同种器官移植免疫耐受的诱导;4、异种移植的抗排斥研究;5、基因治疗在器官移植中的应用;6、各种器官移植的小动物和大动物模型的建立;7、生物人工肝的研究等。其中近期重点研究方向是新型器官保存液特别是HCA肾保存液的下一代产品的开发研制以及适合我国国情的可用于肝脏保存的UW替代溶液的开发。 研究所的临床工作的发展方向将主要在以下几个方面：1、继续大力加强肾、肝移植工作，保持国内领先进水平;在稳步提高移植数量的基础上，进一步提高诊断水平和治疗效果，最大限度地降低并发症发生率和死亡率;2、开展活体肝移植、减体积肝移植及小儿肝移植;3、移植患者重症肺部感染的预防和救治;4、肝移植术后的重症监护和并发症防治;5、器官移植后慢性排斥的预防和治疗;6、移植物功能延迟恢复患者的治疗;7、新型免疫抑制剂的临床应用研究;8、免疫抑制剂的个体化用药研究等等。