骨科是南山医院重点科室。有医生13名，其中副主任医师四名、医学博士一名，医师大多毕业于全国著名的医学院校。设有病床50张，配备心电监护及人工呼吸机等抢救设备。还配备了C型臂X光机，床边照片X光机，手提便携式X光机，椎间盘镜手术系统。拥有先进的电脑骨折治疗仪及关节功能康复器（CPM）等－批物理康复设备，同时还拥有超声血流探测仪，手术显微镜等国内、外先进设备。

在医疗技术、科研、教学各方面紧跟国内外最新医学进展，广泛开展了各种临床业务，在脊柱外科、骨关节病，创伤外科的技术水平达到了卫生部对三级甲等医院的标准，骨外固定技术处于国内先进水平。骨科设有独立的骨科门诊，创伤专科门诊。