武汉市儿童医院心血管内科最初建立于1974年，建立之初规模很小，是与肾脏疾病合并为一个科室，只能收治一般的心肌炎、心律失常、简单先天性心脏病等。经过十余年建设，取得很大的发展，建成了拥有50张床位，独立的心电生理室的特色专科。
　　经过40年的建设和发展，目前作为湖北省儿童心血管疾病诊疗中心这一省级重点专科，心血管内科承担着省内外儿科心脏病患儿门诊和住院诊疗工作, 科室拥有专业医护人员32人（医师13人，护士19人），其中高级职称5人，中级职称7人。博士1人，硕士7人。该科能规范治疗儿童心律失常，心肌病、心肌炎、风湿性心脏病、川崎病及小儿高血压病，尤其在先天性心脏病合并反复肺部感染、慢性心功能不全的治疗及复杂先天性心脏病的诊断等方面达到国内先进水平。可以熟练开展心导管及心血管造影检查，并能成功地应用介入方法治疗肺动脉瓣狭窄、主动脉缩窄、动脉导管未闭、房间隔缺损，室间隔缺损等先天性心脏病。能成功开展婴幼儿永久起搏器植入术。能熟练开展经食道心房调博心脏电生理检查，该技术在省内儿科处于领先水平。