新疆医科大学附属中医院针灸科始建1959年，在著名针灸专家杜毓来主任医师的带领下，成为医院品牌建设的重要组成部分。在临床医疗、科学领域、外事教学等方面取得了较好的成绩，在全疆处于领先地位。
现在科主任马忠副主任医师的带领下，拥有全国、全疆知名的老专家，如沈宝藩、霍迎春、申旭德、吴明达主任医师等专家教授，拥有尹改珍教授、刘智艳教授、赵华副教授等学科带头人。现有主任医师、教授6名，副主任医师、副教授8名，主治医师5人，住院医师4人，在读博士1名，硕士研究生6名。
全科设有门诊、病区,门诊有主治以上医师主诊，日门诊量200人次左右，年门诊量80000人次。经治病症上百种，在内、外、妇、儿及各种疑难病症的治疗上，采用传统针灸、中药，西药、康复等治疗手段，收到良好治疗效果。门诊开设有针灸美容室、针灸埋线减肥室、针刺配合音乐疗法治疗亚健康状态室、中风病治疗室、面瘫治疗室等；病区有46张核定床位，收治病种达60余种，病床使用率120％以上，主诊脑血管病，膝关节病，风湿病，面神经炎等，特色病：中风病，小艾柱压灸治疗眩晕，火针治疗风湿关节炎，化脓灸治疗哮喘，结肠炎、直肠炎，健康减肥，针刺美容，各种疼痛类疾病，申报多次国家级、自治区级、院级、校级科研课题。
科室现作为医院的重点学科、特色学科，本着把特色转变成优势，我们和天津中医学院一附院、北京中医药大学、广东省中医院、新疆军区总医院神经内科有良好的协作关系。由于学术影响的扩大，学术地位的提高，许多下级和省级医院向科室输送和推荐病人。
二、科研与教学
针灸临床教研室是新疆医科大学151工程优秀课程，新疆医科大学中医学院针灸硕士点，为我科未来发展提供根本保证。全科积极参加国家级、院级、校级各项科研课，近年参加：1、腧穴的临床探究与应用；2、针灸减肥与美容；3、针灸戒毒；现已完成省级课题1项，院校级课题3项，目前正在申报国家自然科学基金项目1项，省厅级课题1项。
年科室共发表论文10余篇，有教学职称人员认真做好排课临床代教，课堂授课，考教分离等教学工作，无教学差错事故.同时积极参加科研工作,做了二期、三期临床药理基地的研课题上百例，积累了科研经验.为加强内涵建设,外塑形象,我科较为圆满的举办了全国针灸学会及全疆针灸学习班，特邀疆内外著名针灸专家讲座及查房指导，提高了科室的学术影响及针灸医师的临床水平在不断提高。
三、科室专业特色
普通治疗室
主导病种除脑血管病急性期，恢复期，后遗症期多见外，尚有面神经炎，坐骨神经痛，风湿病，骨关节病及其他一些神经系统疾病。配备有独立的理疗室。这种四位一体的治疗方法是完备的（针，药，理疗，推拿）。目前我科是医院的重点学科之一，在针灸治疗中风病、面瘫等神经系统疾病方面积累了大量丰富经验，并在临床治疗上取得明显疗效，创造了一定的社会和经济效益，在乌鲁木齐和全疆同行业中产生较大影响。
睡眠治疗室
在几代人治疗失眠等身心疾病临床实践成果的基础上，依据中医经络理论创立了音乐针灸疗法，集声学、中医针灸学于一体，不是简单的音乐加针灸，而是把中医经络理论融入音乐之中，并体现了中医的辩证施治，在治疗过程中使音乐与针灸有机的结合，在令人身心舒缓的背景音乐下，使患者处于冥想之中，配以深谙中医经络者的吟诵，能更好的发挥疏通经络，调和气血,从而达到扶正祛邪，补益气血，协调阴效果。
门诊时间：周一下午、周二、四上午
赵华副主任医师、副教授负责出诊。
穴位埋线疗法诊室
穴位埋线疗法是根据经络理论与现代生物全息论，综合运用生物、物理、化学、神经定位诊断等理论，将可吸收性羊肠线植入人体穴位的一种综合效的刺激疗法。穴位埋线疗法在慢性疾病康复中早已被人们所接受，近年来亚健康状态如单纯性肥胖也得到广泛的应用。此疗法具有操作简便、安全、有效、无毒副作用等特点。
穴位埋线治疗原理和针灸治疗原理相同。植入的羊肠线在穴位内,具有长期持久的刺激作用,同时人体活动时优如针灸行针,如运用灵活得当,可根据病情轻重虚实等证不同,施穴用线多少刺激轻重不同而掌握补泻方法,以达到疏通经络、平逆阴阳、调节经气的目地。对大脑皮层、植物神经系统、呼吸系统、心血管系统、消化系统、血液系统、泌尿系统、男女性生殖系统、内分泌系统、免疫系统等功能有良性调整作用。
对各种慢性疾病每周或两周只需来医院诊疗一次，既可以达到长久持续的作用。减少病人每天针灸之麻烦和痛苦,以提高远期疗效。最适合上班族及学生患者。
收治范围：单纯性肥胖、痤疮、面部黄褐斑、各种免疫功能低下、顽固性哮喘、过敏性鼻炎、癫痫、各种妇女经前综合症、更年期综合症、慢性胃肠炎等。
疗程：每周或两周治疗一次，四次为一个疗程