中医科成立于1956年6月，成立之初仅在门诊治疗一般性内科疾病。1957年成立针灸室，应用针灸治疗关节炎、扭伤、电光性眼炎。1962年9月中医科在内科系统开设病床20 张，开展中西医结合治疗乙脑、中毒性菌痢、脉管炎、急慢性肾炎等。经过30年的发展到1986年，应用中医中药治疗的病种已由单一的内科病拓展到外科、儿科、妇科和皮肤科等疾病，尤其是对肿瘤和职业中毒的治疗取得一定效果，治疗妇科、儿科疑难杂症也有突破，用针灸治疗风湿关节炎、中风后遗症、颜面神经麻痹、尿潴留等症疗效明显。1987年6月正式成立中医科病房，设病床36张，先后购进电子痔疮机、牵引床、中频治疗仪、综合电针仪等设备，收治内科痔瘘、腰椎疾病、骨伤病人，对内科、肛肠、慢性退行性疾病采用中西医结合方法治疗取得明显疗效。2004年，经红河州卫生局报州机构编制委员会批准，中医科更名为中西医结合科。