癫痫的诊断与外科治疗，特别是对于神经调控治疗癫痫、帕金森病和阿尔兹海默病的研究。三叉神经痛及面肌痉挛的微创神经外科治疗等功能神经外科疾病。脑血管病的外科治疗：颈动脉斑块、脑梗塞、脑出血、脑动脉瘤等脑血管病的外科治疗。

吕彦恩，男，主任医师，教授，医学博士，研究生导师。中国抗癫痫协会理事，北京市抗癫痫协会理事，中华医学会神经外科专业委员会会员。长期从事癫痫、脑血管病的临床及研究工作。在我国较早开展了全数字化视频脑电监测下的癫痫外科治疗，实施药物难治性癫痫手术约600余例次，效果满意。完成各类出血及缺血性脑血管病手术2100余台，对于高血压脑出血、蛛网膜下腔出血、脑血管畸形、颅内动脉瘤及颈动脉狭窄手术治疗有丰富临床经验。 完成“迷走神经刺激治疗癫痫的电生理机制及神经刺激系统研制的实验研究”、“脑胶质瘤免疫基因治疗实验研究”和“替莫唑胺随机对照临床研究”的课题研究。目前正在开展“迷走神经刺激治疗难治性癫痫”、“癫痫的定位诊断和外科治疗”及“缺血性脑血管病的外科治疗”的研究。曾参加多次国际、国内研讨会，在会议和专业期刊发表学术论文60余篇，SCI 2篇。