红斑狼疮，干燥症，关节炎，硬皮病，肌炎，血管炎，脊柱关节病，造血干细胞移植，异体间充质干细胞移植。

    孙凌云，男，主任医师，教授，生于1962年8月，毕业于南京医科大学，获博士学位，2000年至今任主任医师，教授，博士生导师。曾先后到意大利、日本、英国和澳大亚留学。目前正在培养的在读硕博士研究生12名；现任中华风湿病学会常委，江苏风湿病学会主任委员，江苏中西医结合风湿病学会副主任委员，江苏省医学会常务理事，江苏省免疫学会常务理事，中华医学杂志、中华风湿病学杂志、江苏医药、医学研究生学报等十多家杂志编委。 享受国务院特殊津贴，为江苏省“333”工程人才，江苏省卫生厅“135”重点人才，江苏省有突出贡献的中青年专家，南京市首批有突出贡献的中青年专家，南京市劳模，南京市十大杰出青年，南京市优秀中青年医学专家，南京市中青年拔尖人才，南京大学医学院优秀教师，多次被评为鼓楼医院和南京市卫生系统先进工作者。 自1993年担任科主任以来，带领全科同事发奋图强，专科在原有的基础上，诊断和治疗水平达到国内先进，省内领先地位，成为南京市重点学科和江苏省临床医学重点专科。专科的规模为全省最大，自1998年底在亚洲率先开展造血干细胞移植治疗红斑狼疮，又在国内风湿病科率先建立了层流病房，引进全套干细胞移植设备，能独立开展造血干细胞移植治疗红斑狼疮及其他自身免疫病，2007年在国际上开展了异体骨髓间质干细胞移植治疗红斑狼疮。专科实验室也配备了大量的常规仪器。承担南大医学院，南京医科大学，南京中医药大学硕士生的授课。举办国家级继续教育学习班5期，承办首届全国中青年风湿病骨干医师会议和第11次全国风湿病学术会议。 完成国家省市科研课题15项，获得省卫生厅和南京市重大项目基金各3项，总经费600余万元，获得市科技进步奖10项。发表论文200余篇，参编著作12部，主编专著2部。确定专科目前的主攻方向为1：红斑狼疮干细胞的基础和临床研究。2：红斑狼疮发病机制的研究。3类风湿关节炎的诊治研究。构建人才梯队，学科目前和英国美国等多所大学建立了合作研究，定期派送科室人员去国外学习。科室目前在孙凌云主任的带领下学风正，人心齐，干劲足，专科工作运转有条不紊。