北京协和医院泌尿外科始建于二十世纪四十年代。目前有在职正副教授13位，主治医师10名，住院医师20名。博士及博士后9位。科室根据泌尿外科的专业及病种特点划分为肾上腺外科学组、前列腺学组、泌尿系肿瘤学组、肾移植学组、泌尿系腔镜及微创治疗学组、男科学组、泌尿外科实验研究室等专业学组。各学组分别由一到二名副高以上医师担纲，在各自领域处于国内或国际领先水平。
　 北京协和医院泌尿外科现有床位80张，科室具备先进完备的检查、检验及治疗设施，可以进行各种泌尿外科所需的临床检查化验和治疗。拥有国内一流的膀胱镜检查造影设备、体外震波碎石机、超声波诊断仪、尿流动力学诊断仪、前列腺癌短距离治疗仪和先进的腔道泌尿外科诊断治疗设备。
　 肾上腺外科病例数及诊治水平是我科传统优势项目，每年开展肾上腺外科手术超过100例，多年来不仅解除了患者的病痛，而且一直保持零死亡率。
前列腺增生科诊治成为国内掌握该项技术的最好单位之一。该项技术曾获得卫生部科技进步二等奖。目前已累积病例5000例以上。TURP占据BPH手术的90%以上，达到国际先进水平。