该科是赣、鄂、皖相邻三地规模最大的口腔医疗中心之一。承担九江学院口腔专业的教学与临床实习任务，是全市唯一集教学、科研、医疗、预防保健为一体的牙病医疗防治中心。为江西省最早两家国际“微笑列车”合作医疗机构之一，综合实力在相邻地区属于领先地位。口腔科现有教授、主任医师3名，副教授、副主任医师3名，硕士生3名。门诊治疗面积400平方米，病床10张，牙科治疗椅12台，颌骨全景X光机1台，牙科X光机1台，Biocare种植机一台，口腔实验室、江西省高校系统生物学临床应用重点实验室口腔实验区等。2004年初引进的丹麦DAC-2000及以色列成套牙科器械消毒设备，保证了一人一牙钻和所有操作器械的清洗和消毒，并实行一人一次性初诊盘等，尽最大限度的避免了诊疗操作中的交叉感染。现口腔科年门诊量16000人次，年手术量400余台，在国内较早开展婴儿期腭裂手术治疗，并成立了唇腭裂序列治疗中心。开展牙体牙髓病、口腔粘膜病、儿童口腔预防保健以及口腔正畸、口腔修复、颌面部肿瘤、头颈部整形、婴幼儿唇腭裂修复手术、牙种植，颌面部美容手术等业务。2002年成为赣鄂皖毗邻地区唯一一家国际微笑列车定点医院，免费为三地贫困儿童实施唇腭裂手术，迄今已完成500余例手术，美国“微笑联盟”基金会于2007年4月19日在九江学院附属医院建立了国际唇腭裂治疗中心并正式挂牌。该中心得到了美国加尼福利亚州立大学旧金山分校的大力协作与支持。