肛肠科始建于１９６４年，现有工作人员１４人，主任医师１人，副主任医师２人，博士１人，硕士１人，中级职称医护人员５人，可以开展肛肠外科范围内大部分手术，如各种大肠癌根治术、淋巴结清扫术、各种粪囊成形术、骺尾部及盆腔肿瘤切除术，各种先天性巨结肠手术，各种括约肌成形术、股薄肌、臀大肌代括约手术等。２０余年共完成大肠癌手术３０００余例。目前肛肠科主要业务是诊治各种肛门、大肠疾患，每年完成各种大肠癌手术近２００例，各种肛门疾患３００余例。新开展的业务有：１、各种大肠癌肝转移外科治疗；２、一次性双重吻合器治疗直肠中、下段癌，扩大了保肛手术适应症和提高了患者生活质量；３、全结肠切除，回肠储粪束直肠吻合术治疗溃疡性结肠炎；４、直肠癌术后性功能障碍的治疗；５、直肠出口梗阻性便秘的外科治疗；６、炎症性肠病的外科治疗；７、外拨内扎术加阴道成形术治疗重度混合痔。８、慢传输性便秘的外科治疗；９、ＰＰＨ手术治疗中重度混合痔。目前与ＣＴ室合作“多层面螺旋ＣＴ　、仿真内窥镜在大肠肿瘤诊断价值应用研究”。与病理科合作“大肠癌患者外周血Ｔ细胞ｒ－ＤＮＡ转氨酶的研究”。与病理科合作“ＴＣＦ－β、ＬＥＧＦ人体大肠息肉相关因素研究”。　１９７４年引进日本Ｏｌｙｍｐｓ，ＣＦ－ＬＢ２型纤维结肠镜两台，ＰＳＤ高频电凝器一台，是国内较早开展纤维结肠镜检查和大肠息肉电烙摘除的科室，也是甘肃省第一家开展这方面工作的科室。至今为止，共检查患者２万余例，位全省首台。１９９９年引进Ｐｅｔａｘ电子结肠镜一台，使这项业务水平又上了一个新台阶。同时，肛肠科拥有设备基本齐全的科室内小手术室，每年可在科内完成直肠下段及肛门手术６００余例。团结奋进的肛肠科全体医护人员欢迎饱受疾病困绕的各位患者前来就诊。近年来，全科共发表专业论文１００余篇。出版《人工肛门》等专著３部。获省科技成果二等奖１项，获省科委科技成果二等奖１项。参加国际学术交流２次（日本），主办全国第二届肛肠外科学术会议。“大肠癌术后肝转移的外科治疗”、“溃疡性结肠炎的外科治疗”、“一次性消化道吻合器低位直肠癌保肛手术”、“慢传输性便秘的外科治疗”、“ＰＰＨ手术治疗中重度混合痔”达国内先进，填补了省内空白。