口腔科门诊成立于1983年，1992年成立口腔病房，现有专业病床12张。口腔科现有医师12人，其中正高职称2名，副高职称1名，及多名拥有丰富儿童牙科诊疗经验的主治医师，其中具有硕士学位的3名，门诊护师多名，专业技术力量已成梯队。

口腔科专科配置设备有口腔综合治疗台、进口光固化机、超声波洁牙机、口腔超声波综合治疗机、口腔X光机、西门子口腔颌面全景X光机、口腔X光自动洗片机，完备的诊疗设施及优越的诊疗环境使孩子们在更舒适、更快捷条件下完成口腔各项检查与治疗。2004年初引进的丹麦DAC-2000及以色列成套牙科器械消毒设备，保证了一人一牙钻和所有操作器械的清洗和消毒，并实行一人一次性初诊盘等，尽最大限度的避免了诊疗操作中的交叉感染。

现口腔科年门诊量27000人次，唇腭裂年手术量400余台，在国内较早开展婴儿期腭裂手术治疗，并成立了唇腭裂序列治疗中心。开展牙体牙髓病、口腔粘膜病、儿童口腔预防保健以及口腔正畸、口腔修复、颌面部肿瘤、头颈部整形、婴幼儿唇腭裂修复手术、颌面部美容手术等业务，是国内最先开展新生儿唇裂鼻撑及术前正畸治疗。

近几年口腔科共申请到省、市科技厅及省卫生厅的科研项目多项，其中《婴儿期腭裂手术治疗的临床研究》获广州市科技进步二等奖、广东省医药卫生科技三等奖、广州市医药卫生科技进步一等奖。在国家级，省、市级专业杂志发表学术论文论著多篇。

医院非常重视人才的培养及科室专业技术水平的提高。医护人员经常参加国际、国内的专业学术交流，与加拿大、美国同行进行交流，派科室骨干进修学习。同时接纳重庆医大、哈尔滨、南京、青海、昆明、成都、新疆等地儿童医院的专科医师进修，为广东珠三角地区、南京等地儿童医院、妇幼保健院的口腔工作提供技术支持。