吉林大学第二医院神经外科创建于1988年，为吉林省内最早开展神经外科专科诊疗的医学机构之一。历经20余年的发展，目前科室床位100张（一、二疗区各40张床位，现代化神经外科重症监护疗区20张），科室共有医生19人，教授4人，副教授4人，博士研究生导师1人，硕士研究生导师5人。博士学位6人，在读博士3人，专业神经外科护士60余人。年平均收治患者一千五百人次，年平均手术一千余例。
　　脑血管病方面，多年来积累了大量疑难复杂病例及危重症动脉瘤、血管畸形成功的救治经验。现每年完成颅内动脉瘤夹闭手术、脑血管畸形手术一百余例，年治疗动脉硬化性动脉狭窄支架植入、脑血管病介入栓塞等80余例，手术治愈率95%以上。颈内动脉海绵窦瘘及硬脑膜动静脉瘘介入治疗以及超早期动脉溶栓治疗脑血栓达到全国先进水平。
　　颅内肿瘤方面，成功开展了脑干肿瘤切除手术，岩斜区肿瘤切除手术，显微镜下单鼻孔经蝶垂体瘤切除手术、蝶鞍区巨大肿瘤切除手术、桥小脑角及枕大孔区肿瘤切除手术。
　　功能神经外科方面, 对三叉神经痛、舌咽神经痛及面肌痉挛的手术治疗方面技术成熟，能在最短的时间内完成神经根微血管减压手术，手术治愈率98%以上，达到国内先进水平。
　　脊柱及脊髓疾病方面,近年来采用显微神经外科手术技术，完成了椎管内、脊髓内肿瘤及椎旁、脊椎原发和转移肿瘤的显微手术；寰枕畸形和脊髓空洞症的显微外科手术；腰椎皮毛窦、脊髓脊柱裂、脊髓脊膜膨出，骶管内肿瘤，脊髓栓系的显微外科治疗。
　　神经系统危重症抢救：结合中国人民解放军301医院及国外医学中心的成功经验，我科成立了省内先进的神经外科重症监护病房（NICU），配备有先进的多功能生命体征监护仪、呼吸机、人工冰毯等设备，培训30余名专业神经外科护士及专业护理人员，极大程度的提高了危重病人的救治率及术后病人的恢复。
　　近年来，我科与国内外多所医院及研究中心建立了广泛联系，建立远程会诊协作及知名专家手术指导。与北京宣武医院共同建立脑血管疾病联合诊治中心，与北京天坛医院及解放军总医院、北京协和医院、北京中日友好医院及德国Tübingen大学神经外科中心建立协作关系。专家定期来院指导手术及远程会诊，合作科学研究及指导学术发展。伴随科室的稳步成长及学术国际化，我们的技术理念不断更新发展，逐渐形成以医疗中心及疾病专科分组为目标的科室建设发展方向。为医学科学的进步及解决病人痛苦，做出更多的贡献。