肝胆胰外科前身是具有光荣传统的白求恩医科大学第一医院普外科，始建于1960年。现为国家临床重点专科，吉林大学重点学科，吉林大学第一医院优秀学科，吉林省普外科重点实验室，医学硕士、博士授权学科，博士后流动站。吉林省首家卫生部内镜诊疗技术培训基地、吉林大学肝胆胰外科疾病诊疗中心、吉林大学腹腔镜微创外科疾病诊疗中心、吉林省腹腔镜外科中心。承担承担国家、省部级科研课题30余项，获科研基金1000万元，发表学术论文200余篇，获中华科技技术三等奖1项，省科技进步二等奖4项，三等奖4项，医疗成果奖22项。累计培养硕士研究生34名、博士研究生27名。多次成功举办大型国际学术研讨会以及卫生部内镜诊疗培训基地腹腔镜高级培训班，为多家医院培训了100余名技术骨干，先后帮助省内多家医院开展各类腹腔镜手术。我科已成为我国高度专业化的肝胆胰外科医教研中心。
　　科室为吉林省唯一一家专业化的肝胆胰外科疾病诊治中心。现有床位88张。科室拥有腹部彩超、电子十二指肠镜、电子胆道镜、呼吸机、血气分析仪及液电碎石等先进仪器设备。不断开展新技术新疗法，先进的腹腔镜微创外科手术开展已有近20年的历史，常规开展腹腔镜胆囊切除、胆道探查取石、脾切除、胆肠吻合、肝囊肿、肝脓肿开窗引流术及高难度的腹腔镜肝切除、胰腺肿瘤切除、无张力疝修补术等，疗效满意。联合应用腹腔镜、胆道镜及十二指肠镜，实现了胆石症治疗微创化。2005年开展先进的系统性肝段切除治疗肝脏肿瘤，2009年肝切除手术突破年百例大关，并成功开展巨大肝癌切除、扩大半肝切除、肝脏右三叶切除、肝全尾叶切除等高难度手术，临床疗效满意。2012年DCD肝移植的开展延长了肝癌晚期患者的生命。ERCP微创治疗胆管结石、胆管狭窄及无法切除的恶性梗阻性黄疸，年完成近500例，省内领先。对复杂的肝脏肿瘤、肝内胆管结石及门脉高压症诊治具有独特有效的治疗方法，肝胆胰外科疾病诊治达到国内先进水平。
　　肝胆胰外科因工作需要自2013年4月26日正式划分为两个独立的医疗组。

　　肝胆胰外一科现有医生20人，教授3人，副教授3人；博士生导师3人，硕士生导师5人，具有博士学位6人，在读博士4人，先后7人出国进修学习。累计承担国家、省部级科研课题30项，获科研基金1000万元，发表学术论文200余篇，获中华医学科技三等奖1项，省科技进步二等奖4项，三等奖4项，医疗成果奖27项。担任中华医学会外科学分会全国委员1人，专业学组委员4人，省外科学分会名誉主委1人。累计培养硕士研究生42名，博士研究生27名。多次举办大型全国性学术研讨会及卫生部内镜诊疗技术培训基地腹腔镜高级培训班，为多家医院培养技术骨干，先后帮助省内多家医院开展各类腹腔镜手术。肝胆胰外科已成为我国高度专业化的肝胆胰外科医教研中心。
　　现有床位90张，年收治患者3000人，年手术2000例，腹腔镜微创手术达到55%，对肝胆胰脾疾病做到诊断及时、治疗有效，成功救治疑难危重病人。科室拥有腹部彩超、电子十二指肠镜、胆道镜及液电碎石等先进设备。不断开展新技术新疗法，先进的腹腔镜微创外科手术开展已有20年的历史，联合应用腹腔镜、胆道镜及十二指肠镜，实现了胆石症治疗微创化。腹腔镜肝脏、脾脏、胰腺以及疝修补等已成为常规手术。ERCP微创治疗胆管结石、胆管狭窄及无法切除的恶性梗阻性黄疸，年完成500余例，省内领先。
　　2005年开展精准肝切除治疗肝脏肿瘤，常规开展巨大肝癌切除、扩大半肝切除、肝全尾叶切除等高难度手术，并引进国际创新术式（ALPPS）治疗晚期肝癌，在国内率先创建肝胆胰肿瘤术后综合治疗多学科诊疗模式，为患者制定个体化科学合理的综合治疗方案，并参加全国多中心肝癌研究项目2项，开展临床试验项目2项。2011年开展DCD器官捐献肝移植，完成DCD器官捐献100余例，曾24小时连续成功完成2例，在国内DCD试点单位中名列前茅，获国家DCD肝移植资质，吉林省唯一。

　　肝胆胰外科（二组）现有医生12人，教授3人，副教授1人；其中博士生导师1人，硕士生导师3人，具有博士学位5人，先后6人出国进修学习。担任中华医学会、中国医师学会委员3人。肝胆胰外科二组自成立以来始终禀承着‘敬业、求实、严谨、创新’的原有的学科精神，竭诚的为广大患者提供优质的医疗及护理服务，目前无论收治患者数量及手术数量都位居医院前列，我们不断挑战新难度、突破新高度，救治疑难危重病人，完成了数台国内甚至是国际顶级难度的手术，使吉林省肝胆胰外科专科达到了国内领先水平。