眼科门诊是集儿童眼保健与眼科临床治疗为一体的综合性门诊，对新生儿期、婴儿期、幼儿期、学龄前期、学龄期、青春期儿童眼保健工作均有系统的检查方案及健全的管理措施。科室配备有齐全的儿童眼病检测及治疗设备，如：手持式电脑视力筛查仪、间接眼底镜、手持裂隙灯、同视机、点状光检影镜、Timus立体视觉测试卡等。在儿童常见病、多发病的治疗方面经验丰富。开展中药耳穴贴敷预防和治疗儿童睫状肌调节痉挛形成的调节性近视；中药综合治疗麦粒肿、霰粒肿、过敏性眼炎等疾病；学龄前儿童视力筛查等项目在内的儿童眼保健基础技术；早产儿视网膜病变筛查；特别对小儿常见病“新生儿泪囊炎”的治疗已形成该中心小儿眼科的亮点。