苏州大学附属第二医院在1988年建院之初就成立了职业病科，同时设有职业病教研室及职业病的专用实验室，此外本院与职业病诊治相关科室有：放射科、呼吸科（参与尘肺诊断）、眼科（参与放射性眼病的诊断）、五官科（参与物理因素燥音对人体危害的诊断）、皮肤科及预防保健处等，它们都有明确的职业病工作范围和任务：放射性职业病的诊治--主要面向核工业集团公司所属厂、矿、核电站、核设施、研究院、所的核辐射事故的医学应急救援。处理过的放射性损伤包括：急、慢性放射病及放射性皮肤损伤诊治；过量受照人员的医学处理（外照射、内照射、外沾染）；辐射损伤远后期效应的随访等。尘肺的诊治―核工业尘肺诊断以及地方尘肺诊治，病房收治病情较重的矽肺及并发症的病人；职业中毒的诊治--主要针对核工业厂矿，如铅、汞、锰、苯、TNT、一些高分子化合物及其它有毒有害化学物质的防治工作。核电和核设施操纵员及放射性工作人员的职业健康监护是职业病科一项重要工作，每年数次到各地核电站进行健康监护与评价。
　　职业病科有较完善的职业病诊断实验室及相关的仪器设备--职业病实验室与核工业辐射损伤医学应急中心兼容，设在应急中心大楼内，实验室占560m2，含辐射生物，辐射遗传学，洁净实验室，开展放射血液、免疫、细胞遗传、内分泌等方面的诊断和科研工作。
　　职业病科具有职业诊断基本的仪器设备，并具有诊断职业性放射性疾病，尘肺和职业中毒的相适应的专门仪器设备（主要有高千伏X线摄片机、肺功能仪、23000CD三联式观片灯、裂隙灯、钯光检查图谱、淋巴细胞染色体畸变及微核测定所需细胞培养设备、诊断用电测听仪、脑干诱发电位仪、脑电图、肌电图、骨密度仪、萤光显微镜、分光光度计等）。同时具有健全的职业病诊断规范技术规程，质量管理制度和资料档案。
　　职业病科人员情况：职业病科现有在职专业技术人员：主任医师2名、副主任医师5名、主治医师2名、住院医师2名；副主任技师1人、主管技师1人；护理人员9名（护师5名、护士4名）。医院第21病区设有25张病床作为职业病病区，其中抢救病床4张。
　　职业病科是辐射损伤救治的专门化科室，因而对核工业的一、二级医院每年有1-2期医学应急培训任务，指导一、二级医院的辐射损伤救治任务，同时担任苏州大学放射医学本科班的教学任务。
　　放射损伤临床诊治举例：核工业系统：某次反应堆事故过量照射的其中2例急性放射病的救治；6例加速器电子束β烧伤事故的救治； 2例137Cs源局部（手）外照射引起的Ⅲ度放射损伤救治；γ探伤意外照射1人的诊断与健康评价；多家单位的过量照射医学随访患者；地方部门：某合资企业疑意外照射人员的检查诊断等等。
　　其它：职业病中心曾派专家参加国际救治任务，如参加卫生部组织的切尔诺贝利核事故后对白俄罗斯地区甲状腺影响的诊治工作；对格鲁及亚放射源意外照射救治的应急响应；编写多个国家级核行业标准：《核电厂操纵员的健康标准和医学监督规定》的国家标准（GB）、《核与核事故应急医学处理设施和装备的规定》、《过量照射人员的应急处理规定》等。