华东医院消化内科于上世纪七十年代末由我国著名消化病专家张正绪教授、王赞舜教授创立，在著名消化病专家顾同进教授、王根生教授的领导下不断发展壮大，现主任是于晓峰教授。目前科室共有30名医师，其中在编主任医师、教授12人（郑松柏、竺越、保志军、于晓峰、赵尚敏、刘健、王一倩、姚健凤、张赣生、尹曙明、陈洁、项丹妮），副主任医师、副教授8人（夏俊、张伟、张颖、黄海、邹健、虞阳、黄一沁、马建霞），主治医师8人，住院医师1人，大多数医生拥有博士、硕士学位。
　　消化内科设有2个独立的病区（1个为老年消化病区，1个为普通消化病区），共有核定病床81张，年出院病人近2000例；在院本部和闵行门诊部开设有消化专科门诊、消化专家门诊、老年消化专家门诊及脂肪肝、胃肠动力、炎症性肠病等特色专病门诊，年门诊量超过10万人次；还设有独立的消化功能室。
　　科室拥有先进的诊疗及科研设备，医疗、科研、教学齐头并进。医疗质量和安全水平在全院名列前茅，多次被评为院优胜临床（医技）科室。作为复旦大学附属医院，承担着复旦大学医学院本科和研究生教学任务，科室是国家级、市级全科医生规范化培训基地、上海市消化专科培训基地，在历年的教学评比中均名列前茅。目前科室有博士生导师1名，硕士生导师5名，承担国家级、部级、上海市及卫生局课题数20余项。每年发表包括SCI在内的学术论文20余篇。

　　专业特色
　　（1）消化内镜诊疗------作为国内最早开展内镜检查的医院，消化内镜中心拥有染色胃镜，NBI窄波胃镜，超声内镜，肠镜，小肠镜，胶囊内镜等一系列高端先进的仪器设备，能够早期发现诊断胃肠肿瘤及病变，同时进行内镜下治疗；对于消化道急慢性出血进行内镜下诊断及治疗；能够进行食管静脉曲张连环套扎术和硬化剂治疗；能够对由于各种原因导致的消化道狭窄病人进行狭窄扩张、支架置入和胃造瘘术，治疗水平国内领先。
　　（2）老年消化病诊疗------老年消化病诊疗是本科室的特色之一，尤其在老年胃肠动力障碍性疾病、老年人酸相关性疾病、老年幽门螺旋杆菌根除、老年消化病的内镜诊疗等方面积累了丰富的临床经验。
　　（3）胃肠动力疾病诊疗------本科室是上海市最早开展胃肠动力学研究医院之一，能进行各项胃肠动力学专科项目检查，包括24小时食管pH及阻抗监测、胃液pH测定、食管压力测定、直肠肛门压力测定和直肠敏感性检测，在诊治胃肠动力学疾病方面积累了丰富的临床和科研经验，连续3年举办了国家级“胃肠动力性疾病新进展”学习班，并且是上海动力学组副组长单位。
　　（4）幽门螺旋杆菌（Hp)检测与根除------早在上世纪90年代即在国内率先研制了多种Hp根除方案，主持制订了上海市幽门螺旋杆菌检测流程及相关标准；科室拥有先进的质谱仪，可进行对人体无放射性损害的13C呼气试验。Hp诊断的准确性和根除率在全市处于领先地位。
　　（5）慢性肝病的早期诊断------科室新近引进先进的FibroScan肝纤维化检查仪器，可以诊断早期慢性乙型、丙肝、脂肪肝以及肝脏退行性病变的病人肝脏纤维化程度，跟踪评估慢性乙肝及丙肝病人抗病毒治疗疗效，甚至可以预测门静脉高压所致的并发症。此外，CAP软件分析功能可以定量分析脂肪肝严重程度。
　　（6）消化系统疑难杂症和危重症的诊治------对于腹痛、腹块、腹水、消化道出血、肝胰占位病变、黄疸等的鉴别诊断积累了丰富经验。对于上消化道大出血、重症胰腺炎、肠系膜动脉栓塞、肝性脑病等消化系统危重症的抢救，设备齐全、技术成熟、成功率高。为加强宣教，引导慢病病人自我管理，本科室成成立了炎症性肠病、慢性肝病病友俱乐部。