上海儿童医学中心内科始建于1998年，并逐步发展壮大。在内科发展至一定时期后，2012年开始了各亚专业建设。消化内科亚专业是一支年轻而团结、拥有相当专业实力的团队，额定临床床位17张，预计发展至42张，诊治疾病领域包括胃肠道、肝胆及营养。

　　常规开展了电子胃镜、电子肠镜、内镜下介入微创治疗、肝脏组织学检查等先进技术。近日上海交通大学医学院“小儿肝病诊治中心”揭牌仪式暨首次工作会议在附属上海儿童医学中心成功举行，该中心是目前国内屈指可数的儿童肝病诊治中心之一，由我院消化科为牵头单位，下设三个分中心，分别由上海市仁济医院肝脏移植科，上海儿童医院儿内科、上海新华医院儿内科组成。本专科现有高级及中级专科医师6 名。每周一至周五均设有专科门诊，由消化专科医师坐诊。