武汉协和医院病理科病理科承担全院全身各部位活体组织病理检查。年检测常规外检量超过35000例，术中冷冻快速切片超过3200例，免疫组化染色近20000项，同时承接大量外院疑难切片会诊工作。根据临床病理中的难点和热点问题，科室设有乳腺及女性生殖系统、淋巴造血系统、消化系统、泌尿及男性生殖系统、骨关节和软组织、呼吸系统、头颈外科、中枢神经系统和分子病理诊断等亚专科病理分组。为湖北省首批专科医师规范化培养基地。

病理科建有独立的分子病理诊断中心，拥有荧光原位杂交(FISH)、显色原位杂交（CISH）及荧光实时定量PCR（Real time PCR）等分子病理检测平台。可完成HER2基因扩增、EGFR基因扩增和突变、K-RAS基因突变、尿脱落细胞染色体及基因异常、淋巴瘤IGH/CCND1基因和c-myc基因等多种检测，满足临床多学科诊断及治疗需要。在华中地区开展时间最早，开展项目最全。

近5年来承担国家自然科学基金2项，省级课题3项，发表SCI论文12篇，核心及统计源期刊30篇；参编多项著作。