肛肠痔瘘科是西昌市人民医院大力扶持成立的重点专科，现有医护人员10人，专科医师4人，其中高级职称1人，中级职称2人，初级职称2人，其中四川省大肠肛门病专业委员会委员1人，凉山州学术及技术带头人后备人选1人。该科采用中西医结合方法治疗各种肛肠痔瘘疾病。
目前开展的手术：混合痔外剥内扎术、环状混合痔外剥缝结扎内注术、痔疮套扎术（RPH）、选择性痔上粘膜吻合术（TST）、痔上动脉结扎术、内痔注射术、高位复杂性肛瘘挂线治疗术、肛瘘切除缝合术、肛周脓肿根治术、肛周脓肿切开引流术、肛裂切除缝合术、肛裂挂线治疗术、尖锐湿疣切除术、肛乳头切除术，肛管肿瘤切除术、直肠息肉切除术、肛门整形术、肛门紧缩术等。
目前开展的专科手段：中药口服、中药熏洗坐浴、中药灌肠、中药保留灌肠、中药外敷等。
　　该科现有全自动电脑肛肠治疗仪、肛门测压仪、生物反馈仪、中药灌肠仪等设备，可提供全方位肛肠疾病的诊断及治疗。
肛肠疾病痛苦大、恢复慢，病员闻之色变，讳疾忌医，该科采用专科特色手段进行微创及止痛治疗，可达到疾病治疗过程基本无痛，具有手术损伤小、恢复快、痛苦轻的良好效果。该科医护人员将热情的为广大病员服务。