成立于1986年的新疆维吾尔自治区儿科研究所，现有研究员1名，副研究员1名，中级研究人员2名，初级技术人员1名。设在我院医技大楼6楼临床实验中心内。内设病毒室、血液室和免疫室。配有PCR仪、细胞培养箱、超净工作台、酶联免疫检测仪、荧光显微镜、倒置显微镜等先进的科研仪器。自成立以来，承担部、省、厅级课题共6项, 协作课题6项, 自选课题10项。荣获卫生部科技成果三等奖1项，自治区科技进步二等奖2项、三等奖1项，四等奖1项，自治区科技成果2项，卫生厅科技进步奖和院级科技进步奖多项。并面向临床开展多项病毒、支原体、衣原体、螺旋体、囊虫等病原抗体检测，协助临床进行小儿骨髓及外周血象检查。