福建医科大学附属第一医院神经内科由国内知名的神经病学专家慕容慎行教授早年一手创立，于2012年被列为国家临床重点专科建设项目单位，曾先后被评为福建省医学重点学科、福建省优先发展学科、福建医科大学临床医学重点学科以及院重点学科。1986年获硕士学位授权点、2003年获博士学位授权点。现为福建省研究生与专科医师培训双基地，为福建省医学会神经病学分会的挂靠单位，并成立有福建省神经病学研究所。目前开放病床一百四十余张（含分院），拥有视频/动态脑电图、肌电图、经颅多普勒（TCD）等一系列相关辅助科室。通过几代人的努力，在临床医疗、教学及科研各方面均取得了长足进步，形成了神经遗传病、神经肌肉病、脑血管病、癫痫、神经变性、神经免疫与感染、神经心理与认知障碍、头面痛及神经病理性疼痛等稳定的亚专业方向。取得了具有国内外先进水平的一系列标志性成果，形成了可持续发展的良好基础，成为位居国内同类学科前列的先进学科，在福建省医疗卫生事业的发展中发挥着关键的龙头作用。
　　该科室在神经遗传病和肌肉疾病领域具有传统优势，保持了鲜明的特色和强劲的发展势头，目前处于国内领先地位，学科带头人王柠教授目前任中华医学会神经病学分会神经遗传学组组长。此外，卒中的整体治疗、重症肌无力、多发性硬化、隐球菌性脑膜炎等多种神经科疑难病诊疗达到国内先进水平。科室拥有一批梯队结构合理的高素质人才队伍，现有医师40余人，其中教授/主任医师9人，副教授/副主任医师13人，人才队伍中研究生学历比例达80%以上，不仅有德高望重的全国知名专家，也有在国内颇具影响力的学科带头人，此外，还有一个专业的护理队伍。学术团队中曾有2人为“新世纪百千万人才工程”国家级人选、2人为中国青年科技奖获得者。
　　近年来，该学科注重对外合作与交流，与台湾同行保持着密切的联系，多次开展了闽台两地专家互访和学术交流。科室教学力量雄厚，本科、硕士教学分别成为省精品课程和省优质硕士课程，现有博士生导师3人、硕士生导师7人，常年招收博、硕士研究生及进修生，并已接受博士后进站。神经内科具有强大的科研实力，近年来获得了13项国家自然基金以及一批省部级重大、重点项目资助，近年来发表论文300余篇，其中包括Nature Medicine、Nature Genetics、Science等国际顶级杂志在内的SCI源论文30余篇，主编、参编专著、教材7部，获得包括福建省科技进步一等奖在内的30余项科研奖励。