该科1994年4月成立，由肿瘤内科组、外科组组成，经过几年艰苦创业，使肿瘤科得到很快发展，成为闽西地区肿瘤治疗中心。为发展的需要，于2003年2月肿瘤内科组分出成立肿瘤放化疗科，原有肿瘤科改为肿瘤外科。该科拥有35张床位，现有医生7人，其中副主任医师2人，主治医师4人，医师1人，副主任护师1人，护士12人。

目前常规开展的项目有：甲状腺、腮腺、颌下腺、乳腺、胃、肝、胆、胰腺、小肠、结肠、直肠、躯干及四肢浅表等部位良恶性肿瘤手术及综合治疗，开展全甲状腺切除术、面神经解剖，颈部淋巴结清扫术、胃癌联合脏器切除术、左或右半肝切除术、胰十二指肠切除术。熟练使用国产及进口各型号胃肠道吻合器，开展低位直肠癌保肛手术，免除病人造瘘之苦，这项技术在闽西地区处于领先地位；在甲状腺术中显露喉返神经，使喉返神经损伤率大大降低；开展腹腔药泵化疗，以减轻肿瘤病人全身化疗副作用。开展乳腺癌、肝癌、胃肠道等肿瘤普查工作，以便及早发现肿瘤。还开展细针穿刺活检以提高肿瘤等疾病的诊断率。