肝病科始建于2006年9月，建立了重庆市中医院肝病重点专科研究室和名中医工作室。国家中医药管理局重点专科，重庆市中医重点专科。
　　科室概况：肝病专科现有2个住院病区共96张病床，4个专科门诊诊室。现有医务人员50多人，医生17人，其中主任中医师2名，副主任中医师1人，主治（中）医师6人，住院医师8人，其中研究生导师2人，医学博士1人，硕士14人。护理人员33人（其中本科学历10名，全科普及大专学历）。科室现开展的专科诊疗技术有腹水浓缩回输，肝脏硬度值测定（FibroScan），肝动脉化疗栓塞术（TACE）和人工肝支持系统等多项技术，其中特色优势明显，疗效显著的诊疗技术是中西医结合治疗各种病因导致的肝硬化，原发性肝癌，各型病毒性肝炎，自身免疫性肝病，重症肝炎和脂肪肝等。科室已经建立优势病种―肝硬化诊疗技术网络平台，资源可以共享。
　　科室理念：中西结合，中西并重，突出中医肝病的特色优势，创新理论，创新治疗思路和方案，提高肝病的疗效。
　　诊疗能力：科室共建立5个肝病专业组，即肝病消化组，肝病肿瘤组，肝病内分泌组，脂肪肝组和重症肝病组。科室综合实力雄厚，既具有常见急慢性肝病的诊疗能力，又具有处理急危重症肝病和疑难肝病的诊疗能力。如失代偿期肝硬化，肝功能衰竭，晚期肝癌和自身免疫性肝病等。
　　人才培养：科室现建设有中医肝病专家学术团队和基础肝病诊疗团队。科室对每位专业技术人员的培养，均有中长期计划，结合科室业务共性和专业技术人员个性，科室人才培养模式是科学评估，严谨务实，个性张扬，环境宽松。
　　学术动态和交流：科室专业技术人员多次参加美国肝病年会和亚太肝病年会，参加多次国内中西肝病领域学术交流，在相关的城际学术交流中，承担学术讲座的主讲任务。把握肝病发展的最新动态，引领中医肝病的发展方向。
　　业务辐射：肝病科形成医教研一体的中医特色科室，技术力量雄厚，中医肝病基础和临床水平在本市具领先地位，影响川、渝、黔、云、浙、闽等地。
　　核心动力：科室坚持以医疗质量为核心，突出中医肝病的特色和优势为专科业务发展方向，建立健全优势病种和其他常见病种的优化诊疗方案，实践创新并行，保持诊疗方案的科学性和先进性，结合国内外肝病发展动态，重点筛出了四个中医优势和特色最显著的病种，即肝硬化，原发性肝癌，自身免疫性肝病和（非）酒精性脂肪肝。参加国家优势病种临床路径观察协助组：即肝硬化，原发性胆汁性肝硬化和自身免疫性肝炎，现专科发展态势良好。肝病重点病种临床疗效显著，科室每年业务增长70%以上。
　　创新能力：围绕优势病种研究，稳定研究方向，通过对病种中西理论系统学习，历代医家经验继承，提高基础和临床的认识，反复实践于临床，形成专科自身特色的学术思想体系。如“肝为气之治”，“肝脾两脏一体，门静脉系肝脏属中医之脾”等创新理论等。缘此优化诊疗方案，显著提高临床疗效。如肝硬化Ⅰ号方和Ⅱ号方，治疗肝硬化的疗效，高于国内同级医院的平均水平。治疗晚期肝癌（处方保密），不仅能够延长患者生命和提高生活质量，同时能够有效预防手术切除，TACE和RFA等的术后复发。
　　科研能力：肝病科人才梯队完整，结构合理，科研能力较强，先后承担国家及省市级科研课题8项，获得市级科研成果奖2项，开发“退黄合剂”、“柔肝宝颗粒”等多个院内制剂。
　　其他特色：肝病科开展了本专科领域文献记载的中医诊疗方法挖掘、整理与应用。对民间具有价值的方药及特色疗法、诊疗经验和方法进行收集、整理。开展特色疗法（非药物治疗项目：肝病治疗仪，艾箱灸，透皮给药疗法、穴位注射疗法、中药穴位贴敷疗法，肝癌外敷中药止痛膏，中药敷贴神阙穴拔黄术、中药直肠滴入疗法等），研制和使用专科中药制剂。医师熟练掌握了本专科技术及特色疗法。临床应用的专科中药制剂品种有7种（九子转肝胶囊、柔肝宝颗粒、退黄合剂、保肝丸、三金清肝剂、逍遥合剂、香砂六君合剂）制定专科中药制剂研究计划并实施。
　　特色护理：护理上，实行整体护理，从病人的生理、心理、社会各方面对病人实施综合护理，努力为病人提供更好的服务。肝病科全体护士以提高护理质量，提高病人满意度为宗旨，树立“以病人为中心”的人性化服务理念，致力于构造和谐的护理团队，在2011年开展优质护理工作以来，不断优化护理模式，肝病科的护理工作得到各级领导的好评，2012年被评为重庆市卫生系统优质护理先进集体。