中医肺病科（中医呼吸科）是国家临床重点专科，由门诊（B栋三层）、病房（L栋四层）组成。现有主任医师5人，副主任医师1人，主治医师4人，住院医师2人。科室人员以博士学历为主。目前为北京中医药大学博士、硕士培养点。先后承担和参加国家和部局级课题研究多项，是国家中医药管理局临床路径肺系病组长单位。
　　首席专家晁恩祥教授为全国中医肺系病领头人，国医大师，首都国医名师，中央保健专家。科主任张纾难教授为医学博士，博士生导师，兼任世界中联常务理事及呼吸病分会秘书长，中华中医药学会急诊分会副主任委员、肺系病分会常务委员，海峡两岸医药卫生交流协会常务理事及中医药专委会主任委员，中国医师协会养生专业委员会常务委员等。中华中医药学会、中国中西医结合学会科技进步奖评审专家。
　　专业组设置：①限制性肺疾病组（肺间质病，纤维化等）组长：王雪京主任医师；②阻塞性肺疾病组（慢阻肺，哮喘等）组长：韩春生主任医师；③热病与杂病组（感染发热性疾病，过敏性疾病，肺癌等）组长：杨道文主任医师；④门诊组组长：陈燕主任医师。科室倡导“和谐互助，严谨求实”的文化理念，致力建成以中西医结合、内外治结合、药物与非药物治疗结合的“三结合”的模式诊治呼吸系统疾病、发热性疾病及过敏性疾病为专长，以临床医疗为主体，医教研全面协调发展的特色科室。
　　医疗特色
　　1、中医药辨证配合无创呼吸机治疗慢性阻塞性肺疾病（COPD）取得良好疗效；国家级课题中药对COPD稳定期的治疗取得进展，提高了患者的生存质量。
　　2、在国内同行间较早（上世纪90年代初）开始探索中医药治疗肺间质疾病（纤维化）的研究，正在配合行业专项课题进行的中药治疗本病方面具有一定的优势地位。
　　3、中医药、中西医结合治疗慢性咳嗽（如咳嗽变异型哮喘，感冒后咳嗽等）、哮喘、鼻炎等临床疗效显著。
　　4、在开展中医内病外治、内外结合的肺康复治疗（包括冬病夏治的系列中药外治）慢性肺疾病方面独具特色。
　　5、中医、中西医结合诊治肺癌，肺部感染，胸膜炎，支气管扩张，肺源性心脏病，各种发热性疾病及过敏性疾病等在缩短疗程、提高疗效方面具有科室特色。
　　中医肺病二科(中医呼吸二科)系中日友好医院中医诊疗肺病(呼吸系统疾病)的特色临床科室;中医肺病二科(中医呼吸二科)病房，目前设在北京市和平里医院。
　　科室理念
　　科室弘扬中医优势，坚持奉行中医整体状态调节、治病求本。
　　科室主任李友林教授继承发展了中医理论，提出“肺脾为核心的脏腑整体辨证观”，整体辨治肺病;创新了肺病咳喘异病同治方法;首倡“温润辛金培本”的肺病治疗原理。在临床中将中药内服结合独有外治疗法相结合，创立了若干纯中医药治疗方案，将中医治疗手段作为疾病的主要干预及治疗方法。
　　科室特色
　　门诊及病房收治病种以慢性持续期、稳定期或缓解期呼吸系统疾病为主，主要包括慢性咳嗽、哮喘、过敏性疾病(过敏性鼻炎、荨麻疹、湿疹)、慢阻肺、支气管扩张症及肺间质纤维化等疾病。临床治疗方法采用中药内服结合中医外治特色治疗，包括“温润辛金培本火药透皮系列疗法”、“温润辛金培本经穴熨帖系列疗法”、“温润辛金培本鼻热洗填塞疗法”、“温润辛金培本咽部封闭疗法”、“温润辛金培本雾化吸入”等中医系列外治疗法，治疗方法安全可靠，突出中医特色，体现了中医病房的优势所在。
　　学科优势
　　中医肺病二科(中医呼吸二科)涵盖临床与科研工作，科室同时设有研究室、重点实验室，李友林教授同时主持的国家中医药管理局重点研究室(肺病慢性咳喘)是国家中医药管理局重点研究室建设项目之一、全国唯一研究肺病慢性咳喘中医诊治的专门机构。中日友好医院作为第一完成单位，科室主任李友林教授作为第一完成人：《肺病咳喘异病同治方法的研究与应用》，荣获2012年度国家科学技术进步奖二等奖，证书编号：2012-J-234-2-04-R01;《中医肺病咳喘的辨治研究》，荣获2011年度北京市科学技术进步奖二等奖，证书编号：2011中-2-004;《肺病慢性咳喘中医辨治规律及其机制研究》，荣获2011年度中华中医药学会科学技术进步奖一等奖，证书编号：201101-02 LC-23。李友林教授率领的学术团队承担多项国家级科研课题的研究工作，其研究为临床工作的深入开展提供了核心支持，使临床工作与科研工作相辅相成，将临床治疗推向更高的层次。
　　李友林教授团队成员包括海内外专家，其与哈佛大学、多伦多大学、华西医科大学、中国疾病预防控制中心、上海第二军医大学等长期合作，不断拓展研究广度及深度，旨在进一步推动中医学术的发展，深化对中医理论的认识，为临床工作提供有力的技术支持及保障。