心内科是该院市级重点学科，是衢州市心血管疾病的预防、诊治、科研、教学中心，也是该地区心血管急危重症疾病的诊治和急救中心，并承担衢州市心脑血管病防治办公室日常工作。心内科现有医务人员26名，其中主任医师4名，副主任医师2名。市级名医1名，市卫生系统学科带头人2名，后备学科带头人2名，衢州市“115” 人才工程4名，医学硕士3人、研究生学历1人。主要医疗设备:飞利浦5000型DSA血管造影机、多台心脏彩色多普勒超声仪、动态心电图记录仪、动态血压记录仪、心电向量图、心室晚电位分析仪、运动平板试验仪、除颤起搏监护仪、起搏测试仪以及各种起搏器程控仪、心内电生理记录仪、电生理刺激仪及射频消融仪、CCU中央监护系统等。目前，科室年门诊量超过36000人次，年住院人数超过1400人次。心内科在急性心肌梗死、各种严重心律失常、顽固性心衰、心源性休克、心包填塞等危重症的抢救方面积累了丰富的成功经验，在高血压病、冠心病、高脂血症、动脉硬化等常见病的诊治方面引进并应用了多项先进技术。特别是在心血管介入领域，为衢州地区最早获得省卫生厅心血管介入诊疗资质的单位。
　　学科成绩：现已经先后开展了经股动脉、桡动脉冠状动脉造影、冠状动脉内球囊扩张、支架植入术、肾动脉内球囊扩张、支架植入术，主动脉球囊反搏在危重病人抢救中应用，床旁临时心脏起搏，单腔、双腔、自动除颤起搏器、心室再同步化起搏器植入术，开展了心律失常射频消融治疗等。在起搏器治疗方面，该科已经常规开展了心室主动电极高位室间隔起搏，并且在植入路径上做了改进，目前常规穿刺腋静脉植入技术，进一步提高了手术安全性，减少并发症，并在省内地区级医院中最早开展了Secureselect起搏电极系统在起搏器植入中应用，取得了理想效果。在快速性心律失常治疗方面，开展了心脏电生理检查及射频消融术治疗室上性心动过速，右室流出道室早的射频消融术治疗。同时该科还承担全市危重病人(包括危重孕产妇)的会诊抢救工作，收治下级医院转送的危重、疑难病人，取得了良好的社会效益。