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典型病例为粒细胞缺乏或接受广谱抗生素、免疫抑制剂和糖皮质激素过程中出现不能解释的发热，胸部症状以干咳、胸痛最常见。咯血虽不如前两种症状常见，但十分重要，具有提示性诊断价值。当肺内病变广泛时则出现气急、甚至呼吸衰竭。此外，尚可出现胃肠出血及各种中枢神经系统症状。肺部体征取决于病变的性质和范围，当累及胸膜时可出现胸膜摩擦感或摩擦音。
如前所述，在高危患者出现不能解释的发热、咯血和肺浸润时应充分考虑本病的可能。急性侵袭型肺曲霉病的确诊是困难的。痰标本曲霉培养阳性率甚低(8%～34%)，而且阳性结果可以是源于本菌在上呼吸道的定植污染，应结合临床考虑，如果患者有相应基础疾病或高危因素存在则有重要参考价值。
确诊有赖于应用防污染从下呼吸道采集分泌物培养或作肺活检病理学检查。但这种创伤性诊断的应用往往受到患者临床严重病情的限制，其阳性率也受到操作者水平的影响。无论如何，本病预后在很大程度上取决于早期诊断和早期治疗，故对于创伤性诊断应取积极态度。血清免疫学方法检测抗体其敏感性甚低，很少应用价值。目前正研究检测曲霉抗原以诊断本病，据报道放射免疫检测血清曲霉抗原敏感性和特异性分别达到74%和90%，值得深入研究和积累经验。
