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1.消化道症状 腹泻每天数次或10多次，大便性状与病原有关，可呈稀水样便、黏液便、血样便，患儿常有食欲不振、腹胀、呕吐。
不同病原所致的新生儿流行性腹泻各有一定特点：
（1）大肠埃希杆菌肠炎：致病性大肠埃希杆菌肠炎大便为水样、蛋花汤样，有腥臭味；产毒性大肠埃希杆菌肠炎大便为稀水样；侵袭性大肠埃希杆菌肠炎大便呈黏液脓血样，有腥臭味，大便量不多。
（2）鼠伤寒沙门菌肠炎：大便性状多变，可呈水样、黏冻样、黑绿色或灰白色，有明显的腥臭味。
（3）轮状病毒肠炎：起病急，常发热，大便稀水样，量多，腥臭味可不明显。
（4）金黄色葡萄球菌肠炎：大便多为黄绿色、暗绿色、水样，有腥臭味。
（5）真菌性肠炎：大便呈黄绿色稀水样，或豆腐渣样，泡沫多。
2.全身症状 常有发热、精神萎靡、哭吵不安，严重者出现嗜睡、面色苍白、唇周发绀。
3.水、电解质平衡紊乱 新生儿腹泻常在短时间内发生脱水、酸中毒、低钠血症、低钾血症等并发症，严重者面色发灰、皮肤花纹、四肢发凉、尿少，出现休克。
4.其他 有些患儿同时伴有其他部位感染，如肺炎、中耳炎、尿路感染、鹅口疮、败血症等。
